Presence of extra-pulmonary treatable traits in people with COPD increases the likelihood of responding to pulmonary rehabilitation

Introduction: Evidence suggests that people with chronic obstructive pulmonary disease (COPD) who have worse clinical status (e.g., higher symptom burden) at baseline respond better to pulmonary rehabilitation. Identification of treatable traits in this population might help to better distinguish responders from non-responders, which could aid optimisation of the intervention in the future. This study aimed to explore the impact of pulmonary rehabilitation on extra-pulmonary traits of people with COPD and whether the presence of these treatable traits at baseline influences the type of response (responder or non-responder) to pulmonary rehabilitation. Methods: An observational retrospective study was conducted. A comprehensive extra-pulmonary treatable traits’ assessment including symptoms (dyspnoea, fatigue, anxiety, and depression), functional status, balance, impact of the disease and healthrelated quality of life, was conducted before and after a 12-week com-munity-based pulmonary rehabilitation programme. Pre-post differences between people with or without each TT were compared with independent samples t-tests or Mann-Whitney U tests. The proportion of responders between groups (with or without treatable traits) were explored with chi-square tests and odds ratio. Results: A total of 102 people with COPD (70 [65; 75] years old, 78% male, FEV1 47 [36; 60]% predicted) were included. People with COPD had a median [min-max] of 3 [0-7] treatable traits per person and each responded on average to 5 [0-9] outcomes of pulmonary rehabilitation. People with identified treatable traits at baseline were more responsive than those without them in all outcomes (p < 0.05) except for the 1-minute sit-to-stand test. The presence of treatable traits increased the likelihood of being a good responder in all outcomes (OR: 1.72-19.95) except for the 1-minute sit-to-stand test (p = 0.175).Conclusions: Identification of extra-pulmonary treatable traits in people with COPD showed potential to inform on pulmonary rehabilitation responsiveness and might therefore be an important strategy for patient selection, treatment personalisation and optimisation.publishe

Compartimentalização e dinâmica de potássio em plantas de milho.

A extração de potássio (K) pela cultura do milho é elevada e impacta a fertilidade do solo. O conhecimento da dinâmica de acúmulo e remobilização desse nutriente na planta pode ser importante no estabelecimento de estratégias otimizadas de manejo da adubação e de melhor controle da sua ciclagem em sistemas agrícolas. Objetivou-se caracterizar os compartimentos de acúmulo do K absorvido pelo milho e sua dinâmica entre a fase de formação da espiga e o final do ciclo, sob dois níveis de investimento tecnológico. Foram coletadas plantas no início do enchimento de grãos e após a maturação fisiológica, quantificando-se o teor e acúmulo de K nos componentes da parte aérea. A absorção de K até a fase de enchimento de grãos provoca importante redução da disponibilidade do nutriente no solo nessa época. A maior parte do K presente nas folhas é remobilizado para os grãos ou lavado pela chuva/irrigação no final do ciclo. A exportação na colheita dos grãos corresponde de 31 a 39 % do total acumulado na parte aérea. O colmo, sobretudo o seu terço inferior, é o principal compartimento de armazenamento do K no milho

Cut-off points of the 1-minute sit-to-stand test to detect functional impairment and mortality risk in people with COPD

Introduction: Functional status is a key outcome in people with chronic obstructive pulmonary disease (COPD) and can be defined as an individual’s ability to perform normal daily activities required to meet basic needs, fulfill usual roles, and maintain health and well-being. The 1-minute sit-to-stand test (1-min STS) is a wellestablished measure to assess functional status in people with COPD that can be used in different settings (e.g., office, clinic, hospital, home) with limited resources (i.e., a chair and a stopwatch). This test is a strong predictor of exacerbations, hospitalizations and mortality in people with COPD. Yet, cut-off points to determine functional impairment with the 1-min STS in people with COPD are lacking for use in clinical practice. Recently, our group established a cut-off (19.5 repetitions) for increased mortality risk, however, it still lacks external validation. Objectives: To explore the predictive ability of the 1-min STS to detect functional impairment and the validity of the previously established cut-off for increased risk of mortality in people with COPD. Methods: A cross-sectional study was conducted with people with COPD. Age, sex, body mass index (BMI), lung function, the 1-min STS and the five-repetitions sit-to-stand tests were collected. We used two cut-offs for the five-repetitions sit-to-stand test known to be associated with low functional performance (12.1 seconds) and increased risk of mortality (15.98 seconds) in people with COPD. Receiver operating characteristics analysis (ROC) was performed and the area under the curve (AUC), sensitivity, specificity, and accuracy were calculated. The optimal cut-off points were identified by the highest Younden index. Results: In total, 302 people with COPD (67.5 ± 10.4 years; 79.1% male; BMI 26.7 ± 4.6 kg/m²; FEV1 55.2 ± 20.4%predicted) participated. Cut-off points in the 1-min STS of 23.5 repetitions for low functional performance (AUC = 0.92; 95%CI 0.89-0.95; 96.4% sensitivity; 80.9% specificity; accuracy = 0.84) and 18.5 repetitions for increased risk of mortality (AUC = 0.97; 95%CI 0.94-0.987; 95.5% sensitivity; 88.6% specificity; accuracy = 0.89) were found in people with COPD. Conclusions: The 1-min STS showed an outstanding discriminative ability and excellent accuracy in determining low functional performance and increased risk of mortality in people with COPD. A cut-off of 23.5 repetitions can be used to identify people with functional impairment. The cut-off point found for increased risk of mortality is similar to the previously published using the 6-minute walk test as an anchor, reinforcing the validity of this cut-off. These cut-offs support healthcare professionals in tailoring an appropriate management plan for this treatable trait and might possibly contribute to the implementation of timely preventive or palliative strategies.publishe

KITE : high-performance accurate modelling of electronic structure and response functions of large molecules, disordered crystals and heterostructures

We present KITE, a general purpose open-source tight-binding software for accurate real-space simulations of electronic structure and quantum transport properties of large-scale molecular and condensed systems with tens of billions of atomic orbitals (N ∼ 10^10). KITE’s core is written in C++, with a versatile Python-based interface, and is fully optimized for shared memory multi-node CPU architectures, thus scalable, efficient and fast. At the core of KITE is a seamless spectral expansion of lattice Green’s functions, which enables large-scale calculations of generic target functions with uniform convergence and fine control over energy resolution. Several functionalities are demonstrated, ranging from simulations of local density of states and photo-emission spectroscopy of disordered materials to large-scale computations of optical conductivity tensors and real-space wave-packet propagation in the presence of magneto-static fields and spin–orbit coupling. On-the-fly calculations of real-space Green’s functions are carried out with an efficient domain decomposition technique, allowing KITE to achieve nearly ideal linear scaling in its multi-threading performance. Crystalline defects and disorder, including vacancies, adsorbates and charged impurity centres, can be easily set up with KITE’s intuitive interface, paving the way to user-friendly large-scale quantum simulations of equilibrium and non-equilibrium properties of molecules, disordered crystals and heterostructures subject to a variety of perturbations and external conditions

Aspectos fitossanitários em olival na Beira Interior Norte e na Beira Interior Sul

Comunicação oral apresentada no 6.º Encontro Nacional de Protecção Integrada que decorreu em Castelo Branco, na Escola Superior Agrária do Instituto Politécnico de Castelo Branco, no âmbito do painel sobre o OlivalPara uma análise dos problemas fitossanitários do olival na Beira Interior foram realizados observações e estimativas do risco, em 2002, em quatro olivais na Beira Interior Norte e outros quatro na Beira Interior Sul. Os olivais da Beira Interior Norte ficam localizados nos concelhos de Seia, Pinhel, Guarda e Figueira de Castelo Rodrigo e os da Beira Interior Sul nos concelhos de Penamacor, Fundão, Proença-a-Nova e Vila Velha de Ródão. Os inimigos mais importantes e para que foram feitas estimativas do risco foram: gafa, olho de pavão, mosca-da-azeitona, traça-da-oliveira e cochonilha-negra. Em todos os olivais foram encontrados todos os inimigos avaliados, mas com pouca expressão para o olho de pavão nos olivais da cultivar Galega. Os dados da estimativa do risco são apresentados, assim como o número das intervenções químicas que foram necessárias realizar. São discutidas e comparadas as intervenções realizadas

Planejamento e desenvolvimento de serviço de informação em pesquisa agropecuária: caso do Sistema Aberto e Integrado de Informação em Agricultura (Sabiia).

A experiência com o planejamento e o desenvolvimento de um serviço de informação em pesquisa agropecuária baseado em padrões abertos interoperáveis e software livre é o tema apresentado nesse trabalho. No contexto da organização, tratamento e disseminação da informação na Internet, o Sistema Embrapa de Bibliotecas (SEB), em cooperação com o projeto Acesso Aberto à Informação Científica na Embrapa (liderado pela Embrapa Informação Tecnológica) e a Embrapa Informática Agropecuária, definiram como objetivo estratégico a construção do repositório digital Infoteca-e (Informação Tecnológica em Agricultura), repositório institucional Alice (Acesso Livre à Informação Científica da Embrapa) e do provedor de serviços: Sabiia (Sistema Aberto e Integrado de Informação em Agricultura), com o propósito de favorecer a transferência de tecnologias produzidas pela Embrapa, o aumento da visibilidade da produção científica dos pesquisadores, e da própria instituição, por meio da maximização do acesso à sua própria produção intelectual, e por consequência, a ampliação dos resultados de pesquisa realizados na Embrapa, como também, acessar diversas fontes de informações técnico-científicas de interesse da pesquisa agropecuária. No modelo metodológico proposto no âmbito do projeto, definiu-se a constituição de uma rede de informação técnico-científica na área de pesquisa agropecuária e áreas afins. Sua estruturação leva em consideração a infraestrutura funcional da iniciativa de arquivos aberto (sobre a qual o movimento de acesso aberto à informação científica torna-se factível) que é constituída basicamente dos elementos: i) provedores de dados, ii) provedores de serviços e iii) protocolo de comunicação aberto que permite a exposição e coleta de metadados. O provedor de serviços de informação em pesquisa agropecuária, como um dos elementos do modelo metodológico de gestão da informação científica, constitui-se como o elemento centralizador e canalizador da informação científica interna e da informação científica externa à Embrapa. Por meio do mecanismo de busca oferecido, os usuários recuperam publicações técnico-científicas sobre agricultura e áreas afins em diversas instituições nacionais e internacionais. Portanto, a rede de informação técnico-científica reúne informações de publicações de provedores de dados agropecuários (como periódicos científicos, repositórios digitais institucionais, temáticos e de eventos, bibliotecas digitais e outros) possibilitando o acesso ao texto integral (como livros, capítulos de livros, artigos em periódicos, folhetos, teses, anais, proceedings de eventos, entre outros).CONFOA 2011